徐克将胡金铨的经典武侠片《龙门客栈》加以改写，搬到大陆的沙漠外景实地拍摄，并由李惠民担任导演。剧情主要架构仍是描写侠士周淮安伙同一群绿林好汉救助忠良之后，跟大太监曹少钦和东厂高手在龙门客栈发生尔虞我诈的遭遇战。新版本最大的特色除了大漠风沙的慑人映象之外，便是对三位主角的个性作了新注释。梁家辉与女扮男装的林青霞被塑造成有一段爱情故事的侠士红事，新增加的黑店老板娘张曼玉更是风骚入骨，抢尽风头，形成精彩武打之外有趣的三角感情矛盾。

故事以明朝中期为背景，太监曹少钦掌管锦衣卫和东厂特务机关，权重一时。他迫害兵部尚书于谦后，为斩草除根，又派东厂特务去杀害于谦流放在北疆的儿女。在要塞地龙门客栈里，于谦前心腹萧少兹、客栈掌柜吴宁和前部将朱将军的儿女朱骥、朱辉等正派人士与东厂展开了一场激烈的血腥杀戮，最终消灭了曹太监等人。

国家庆典前一天，首相突然失踪了，与他最后接触的安全局长邱启贤於是成了嫌疑犯。邱启贤的女儿、同样为安全局一员的邱默语(柯佳嬿 饰)为了替父亲洗刷冤屈，带著首相女儿艾心至「龙门城寨」，希望能找到证据替证明

464年，宋孝武帝去世，刘子业即位，改元永光，大赦天下。刘子业的同母姐姐山阴公主刘楚玉爱好鉴赏美人，刘子业赐她门客三十，伴其玩乐。刘楚玉出行游玩，意外坠河，醒来后性情大变，行为失常，引起门客容止注意。楚玉康复，召开春日宴观察府中局势为完成任务而暗自盘算。

故事发生在明朝末年，东厂督公魏忠贤（李立群 饰）手握天下大权意欲称王，御林军总教头周淮安（马景涛 饰）和侠女邱莫言（陈红 饰）同信王朱由检（郭晋安 饰）结盟，里应外合想要推翻魏忠贤的暴政。得知了他们的计划，魏忠贤派出刺客想要出掉朱由检，无奈之下，朱由检踏上逃亡旅途，并和另外两人相约相见于龙门客栈，从长计议。周淮安一行人抵达龙门客栈，哪知道刚出虎口，便落入了狼窝。客栈掌柜金湘玉（夏文汐 饰）亦正亦邪令人捉摸不透，将周淮安等人玩弄于鼓掌之间毫不费劲。随着时间的推移，金湘玉爱上了侠肝义胆的周淮安，而周淮安和门当