「候鸟e人」的故事主轴，围绕着一群关心候鸟生态的年轻人，描写一段从舄湖湿地展开的浪漫爱情，「候鸟e人」的情节就像不同季节候鸟的飞翔路径，从七股到关渡，从马祖无人小岛来到时尚现代的台北街头。小青、邵韩和

红军西路军骑兵团团长龙飞擅用左手刀，令敌人闻风丧胆，因遭遇韩德功带领的黑马团围堵而贻误驰援战机，导致恋人温俪菡的父亲、特派员张布尔的老首长牺牲。张布尔本来就对龙飞和温俪菡的关系不满，加之他对形式判断错误，就秘密下令处决龙飞。龙飞不甘引颈就戮，逃出刑场。在失落、彷徨中，他被奸人所伤而失忆，从此踏上了曲折与苦难并存，心灵流离失所的旅程。抗日战争爆发，龙飞重回组织，受命潜伏在黑马团，执行一项人命关天的秘密任务。国共合作，龙飞与韩德功奔赴抗日前线；捷报连连，二人名声大噪。随之，龙飞真实身份暴露，这给他带来致命的危

宫墙深深迷情锁，江湖雪剑起纷纭。这是一次人间男女至爱至情的时空穿越之旅！这是一场身着古典优雅华服的青春人文放歌！

该剧描述了一段案中案、情中情，大悲大喜，至情至性，有情人终成眷属的佳话。